Animaux à sang chaud, les mammifères marins ont une température corporelle indépendante de celle de leur environnement, si celle-ci toutefois n’est pas trop extrême. Comment se protègent-ils du froid dans les régions polaires ?
Si les mammifères terrestres se protègent du froid, soit en s’isolant de l’air ambiant par une fourrure épaisse, soit en hibernant dans un endroit protégé des températures extrêmes (leur température corporelle s’abaisse alors pour atteindre environ celle du milieu ambiant), les mammifères marins vivent dans un milieu plus hostile et doivent faire face à un facteur de refroidissement non négligeable : le milieu liquide. En effet, l’eau est 25 fois plus conductrice de froid que l’air.
Pour se protéger du grand froid, les pinnipèdes présentent une peau velue. Ce pelage est généralement constitué de deux sortes de poils : les jarres (ou poils de garde), longs, rigides et résistants ; et les poils de bourre, généralement plus serrés, souvent ondulés. Ces poils jouent un rôle de protection thermique, surtout chez les otaries et les lions de mer dont le pannicule graisseux est de faible épaisseur. Les otariidés, du reste, ne plongent pas profondément. Chez les phocidés, les poils doivent intervenir beaucoup plus dans la protection mécanique de la peau que comme isolant thermique. Leur panicule graisseuse est beaucoup plus épaisse et leur fourrure moins dense. Ils plongent généralement plus profondément. Leurs poils croissent un certain temps, puis tombent et la plupart des pinnipèdes ont une mue chaque année.
Chez les cétacés, les poils primitifs ont quasiment disparu lors des 50 millions d’années d’évolution (seules subsistent encore quelques vibrisses au niveau de la tête chez certaines espèces qui n’ont aucun rôle dans la thermorégulation). Ces mammifères marins doivent combattre le grand froid et la déperdition de chaleur par d’autres moyens. Les baleines et les rorquals font face à une adaptation particulière : en effet, ces animaux effectuent des migrations, passant de régions aux eaux froides à d’autres aux eaux tempérées, voire même chaudes. Il est nécessaire que leur degré de tolérance thermique soit exceptionnel. Celui-ci varie, par exemple de 5 à 20 °C chez la baleine franche australe, de 0 à 25 °C chez le rorqual bleu, et de – 2 à + 30 °C chez le mégaptère. L’homéothermie des cétacés leur permet de conserver une température interne constante (35,1 °C chez le rorqual bleu, 36,3 °C chez le rorqual commun et le mégaptère) par rapport au milieu extérieur, dans la limite des capacités de régulation de leur organisme. C’est pourquoi, nous pouvons rencontrer les mysticètes dans les mers chaudes en hiver et froides en été. La couche de graisse est un isolant efficace. Cette couche est d’une épaisseur variable selon l’espèce et aussi selon l’endroit du corps : celle des mysticètes est beaucoup plus importante. L’épaisseur de la couche de graisse varie entre 5 et 35 cm chez un rorqual bleu mâle adulte alors qu’elle est de 14 à 40 cm chez la femelle. Cette graisse représente, par exemple, le quart du poids corporel du rorqual bleu et des autres rorquals et le tiers de celui du mégaptère et du cachalot. Chez les mysticètes, il existe un véritable cycle de cette couche de graisse isolante en fonction de la température de l’eau. Baleines et rorquals effectuent de longues migrations entre les eaux tempérées subtropicales ou tropicales où ils se reproduisent et les eaux froides antarctiques ou subantarctiques où ils s’engraissent. Le coût énergétique de la thermorégulation dans les eaux chaudes (en hiver) est inférieur à celui des eaux plus froides (en été). Ces cétacés vivent alors en hiver aux dépens des réserves de graisse emmagasinées dans leur lard, leur foie et leurs os. En outre, les aliments à haute teneur en lipides sont très calorigènes : c’est le cas de certains poissons pélagiques comme le maquereau ou encore le krill, contrairement aux céphalopodes.