Chapitre 1 : Evaluation des risques dans les écosystèmes conchylicoles
1. Introduction
2. Le risque thermique
3. Le risque « pluviométrie »
4. Le risque trophique
5. Le risque sédimentaire
6. Discussion-Conclusion
7. Bibliographie
Chapitre 2 : Les risques associés à la physiologie de l'huître en période de reproduction
1. Introduction
2. Rappel du matériel et des méthodes utilisés
3. Gamétogenèse, nutrition et mortalités
4. Besoins métaboliques en période estivale
5. Utilisation des réserves en période estivale
6. Nutrition et bilan énergétique en période estivale
7. Déficit immunitaire en période estivale
8. Conclusion
9. Bibliographie
Chapitre 3 : Les riques associés au stress environnemental
1. Introduction
2. Étude expérimentale du stress
3. Sources de perturbations et stress environnemental suivant le modèle « plat-table »
4. Conclusion
5. Bibibliographie
Chapitre 4 :
I - Étude des bases génétiques de la mortalité estivale du naissain et des possibilités d'amélioration de la survie par sélection
1. Introduction : contexte et objectifs
2. Première génération : Estimation de la base génétique de la survie du naissain sur estran en première période estivale
3. Seconde génération : sélection divergente pour une faible ou une forte suivie du naissain sur estran en première période estivale
4. Troisième génération : répétabilité de la réponse à sélection divergente pour une faible ou une forte survie du naissain en première période estivale et expression du caractère chez les triploïdes
5. Quatrième génération : répétabilité de la réponse à la sélection
6. Etude des performances de survie en seconde période estivale sur estran
7. Etude des performances de survie du naissain au laboratoire et corrélations avec les données obtenues sur estran
8. Discussion et perspectives
9. Bibliographie
Annexe : Liste récapitulative des lots étudiés
II – Vers « GIGAS+ » un programme de sélection pour améliorer la survie estivale chez l’huître creuse Crassostrea en France
10. Revue des premières applications des méthodes de sélections à l’échelle de la conchyliculture mondiale
11. Eléments pour l’élaboration d’un programme collectif de sélection pour améliorer la survie estivale des huîtres en France : GIGAS+
12. Bibliographie
Chapitre 5 : Caractérisation phénotypique des souches R Résistantes et S Sensibles à la mortalité estivale
1. Introduction : contexte et objectifs
2. Différences de gamétogenèse et d’effort de reproduction entre R et S
3. Bilan énergétique comparé des souches R et S
4. Les capacités de défense des souches R et S
5. Réponses aux stress des huîtres R et S
6. Taux d’aneuploïdie des huîtres R et S
7. Réponses aux agents pathogènes des huîtres R et S
8. Etude du différentiel d’expression de gènes entre R et S pour identifier la fonction physiologique impliquée dans la résistance à la mortalité estivale
9. Discussion
10. Bibliographie
Chapitre 6 : Les risques associés aux pathogènes
1. Introduction
2. Rechercher et identifier des candidats potentiels
3. Pouvoir pathogène et conditions d’expression de l’infection
4. Recherche de gènes support de la virulence chez les bactéries
