Détection et isolement des champignons du sol

Introduction
Isoler des champignons du sol : pour quoi faire ? 7
Comment faire ? 8
PRINCIPES GÉNÉRAUX
Prélèvement et préparation des échantillons 13
A partir du sol 13
A partir des racines 14
Les techniques d'isolement 17
Isolement à partir du sol 17
Techniques d'isolement direct 17
Les suspensions-dilutions (dilution plates) 18
L'incorporation directe du sol 19
Avantages et inconvénients 19
Techniques de piégeage dites « des appâts » 21
Les pièges inertes 22
Les plantes entières 22
Les fragments de plantes vivantes 24
L'extraction directe 25
Isolement à partir des racines 26
Fragments de racines de petite taille 26
Broyage et suspension 27
Piégeage 27
Facteurs de sélectivité 27
Le traitement de l'échantillon de sol 28
La technique proprement dite 28
Les conditions d'incubation 29
Mise en culture 31
Préparation du milieu d'isolement 31
Éléments de base 32
Source de carbone 32
Source d'azote 32
Rapport O N 33
Eléments minéraux 34
Facteurs de croissance 34
Facteur de solidification du milieu 34
Principaux facteurs de sélectivité 35
Stimulateurs de la croissance 35
Inhibiteurs 35
p H 35
Métaux 36
Antibiotiques antibactériens 36
Antibiotiques antifongiques 38
Fongicides 39
Autres inhibiteurs 40
Autres additifs 42
Stérilisation des milieux 43
Procédure générale 43
Autoclavage 43
Filtration 44
Conservation 44
Incubation des boîtes de Pétri 45
Purification des isolements 46
APPLICATIONS PRATIQUES
Milieux de base 53
Techniques et milieux sélectifs 57
Références bibliographiques 179
Index des composés organiques cités 195
Index des champignons cités 197
Index des techniques et des milieux 201